Вы используете устаревший браузер. Этот и другие сайты могут отображаться в нём некорректно. Вам необходимо обновить браузер или попробовать использовать другой.
#!/usr/bin/perl
use LWP::Simple; #Подключаю LWP
print "Enter Name Site:"; #Вывод сообщения о просьбе ввести адрес сайта
$site = <STDIN>; #Ввод с клавиатуры
print "Enter Columns:"...